يسعى قسم الميكروبيولوجيا الزراعية بكلية الزراعة جامعة دمياط خلال الخمس سنوات القادمة إلى تطوير قدراته التعليمية وتأهيل الطلاب من الناحية الميكروبيولوجية لكى يكونوا قادرين على المنافسة فى سوق العمل وتطوير القدرات البحثية للقسم والنشر الدولى المتميز والتعاون العلمى مع أقسام الميكروبيولوجيا الأخرى داخل جمهورية مصر العربية وخارجها والمساهمة فى خلق بيئة نظيفة وغذاء آمن.